Istraživanje mehanizma djelovanja Cistanche Total Glycosides na upalnu bolest crijeva na temelju mrežne farmakologije i pokusa na životinjama Ⅲ

3 Rezultati i analiza

3.1 Analiza ciljeva ukupnih glikozida Cistanche tubulosa i ciljeva bolesti

Uvezite datoteke trodimenzionalne struktureaktivni sastojciu bazu podataka PharmMapper kako biste dobili odgovarajuće ciljne točke koje odgovaraju različitim sastojcima. Baza podataka UniProt korištena je za dobivanje naziva proteina i informacija o imenu gena koji odgovaraju svakoj meti. Kombinacijom ciljnih točaka koje odgovaraju sedam komponenti, dobivene su ukupno 354 mete. U bazi podataka GeneCards relevantni geni su pretraživani pomoću ključne riječi "upalna bolest crijeva", a rezultati pretraživanja su sortirani, te je u konačnici dobivena 7851 meta. Upotrijebite događaje za crtanje Vennovog dijagrama na mreži kako biste dobili sjecište ciljnih aktivnih sastojaka Cistanche tubulosa i ciljnih točaka IBD-a. Kao što je prikazano na slici 1, 254 cilja aktivnog sastojkaCistanchekoji imaju zaštitni učinak na IBD.

Slika 2 PPI-mrežni dijagram zajedničkih ciljeva

Slika 5. Mreža putanja komponenta-cilj

Slika 7 Ukupni glikozidi Cistanche tubulosa smanjuju mRNA TGF- i mTOR signalnih putova u IBD miševa

Ukupni glikozidi 3.4 Cistanche tubulosa poboljšavaju DAI rezultat izazvan DSS-om

Rezultati ispitivanja su pokazali da su, osim CZ skupine, ostale tri skupine imale različite stupnjeve gubitka tjelesne težine i okultnu krv u stolici (Slika 6). Među njima, DSS kontrolna skupina imala je najveću stopu gubitka tjelesne težine, najjaču fekalnu krv, najveći DAI i očito fekalno krvarenje 6. dana. Nakon intervencije ukupnih glikozida Cistanche tubulosa, DAI rezultat se postupno smanjivao, a stanje okultne krvi postupno se smanjivalo. Skupina HZ imala je najnižu stopu gubitka tjelesne težine i najmanju količinu skrivene krvi u fecesu. Rezultati su pokazali da ukupni glikozidi Cistanche tubulosa poboljšavaju fiziološke reakcije uzrokovane upalnom bolešću crijeva.

CISTANCHE DODATAK ZA LIJEČENJE IBD-a PHGS75% ECH 30% ACT 12%

3.5 Ukupni glikozidi Cistanche tubulosa smanjuju IBD

Ekspresija signalnih putova mTOR i TGF u slezeni miša Signalni putovi mTOR i TGF dva su važna signalna puta koji aktiviraju upalne odgovore. Ekspresija mTOR-a i TGF-a u tkivu slezene miševa detektirana je qRT-PCR-om. Rezultati su pokazali da je ekspresija mRNA mTOR-a i TGF-a u DSS kontrolnoj skupini miševa značajno povećana u usporedbi s onom u normalnih miševa. U usporedbi s DSS kontrolnim miševima, u usporedbi s Cistanche tubulosa, ekspresija mTOR i TGF- kod miševa je značajno smanjena nakon intervencije Cistanche tubulosa. Među njima, skupina s visokom dozom imala je najznačajniji pad, a razina ekspresije bila je u osnovi u skladu s onom u normalnoj skupini (Slika 7). Rezultati su pokazali da ukupni glikozidi Cistanche tubulosa smanjuju ekspresiju mTOR i TGF signalnih putova.

Slika 8. Toplinska karta PICRUSt2-funkcionalnog klasteriranja obilja

3.6 Analiza funkcionalnih zabilješki PICRUSt2

PICRUSt2 je bioinformatički alat za predviđanje metagenomske funkcije na temelju informacija o biološkoj 16S rRNA, ASV stablu i ASV genu u bazi podataka Greengene. Za funkcionalno predviđanje korištena je Select COG baza podataka, a rezultati su pokazali da funkcije crijevne flore uglavnom uključuju procesiranje RNA; struktura i dinamika kromatina; kontrola staničnog ciklusa, stanična dioba, segmentacija kromosoma; obrambeni mehanizam; signalizacija stanične stijenke/stanične membrane/biogeneze ovojnice; stanice Ima više od 20 funkcija kao što su izvanstanična struktura; unutarstanični transport, sekrecija i transport vezikula; proizvodnja i pretvorba energije; transport i metabolizam ugljikohidrata. Odaberite prvih 15 najzastupljenijih značajki i podatke o njihovom obilju u svakom uzorkuToplinska karta (Slika 8) nacrtana je za informacije i grupirana s različitih funkcionalnih razina.

U usporedbi sa skupinom CZ, miševi kontrolne skupine DZ imali su COG1132 (ABC-tip transportnog sustava za više lijekova), COG0745 (regulator odgovora na vezanje DNA), COG1131 (ABC-tip transportnog sustava za više lijekova), COG1961 (DNA rekombinaza specifična za mjesto povezana s DNA invertaza Pin ), COG0438 (uključena glikoziltransferazau biosintezi stanične stijenke), COG0534 (pokrenut Na +-višestruka efluksna pumpa), COG0642 (transdukcija signala histidin kinaza), COG1595 (DNA-usmjerena RNA polimeraza specijalizirana sigma podjedinica), COG0463 (Endonukleaza), COG4974 (Site-specific recombinase XerD), COG2207 (AraC-tip DNA vezne domene i AraC - koji sadrži proteine), COG1136 (izvozni sustav lipoproteina tipa ABC) i abnormalnosti funkcionalne ekspresije gena COG1309 (transkripcijski regulator koji veže DNA). Ovi geni su uglavnom uključeni u: V: obrambeni mehanizam; T: mehanizam prijenosa signala; M: stanična stijenka/stanična membrana/biogeneza ovojnice; I: transport i metabolizam lipida; K: transkripcija; L: replikacija, rekombinacija i popravak.

Nakon što su ovih šest funkcija dobile ukupne glikozide Cistanche tubulosa, ekspresija ovih različitih fizioloških funkcija bila je bliska onima normalne skupine. U usporedbi s miševima u skupinama CZ i DZ, miševi u skupini HZ imali su visoku ekspresiju gena COG1028 (familija alkoholne dehidrogenaze kratkog lanca) i COG0451 (nukleozid-fosfat-šećerna epimeraza). Ova dva gena povezana su s I: transport lipida i metabolizam. I M: Funkcije biogeneze stanične stijenke/stanične membrane/omotače usko su povezane. Stoga se nagađa da ukupni glikozidi Cistanche tubulosa mogu regulirati oštećenje IBD miševa reguliranjem metabolizma lipida, metabolizma glukoze i srodnih mehanizama prijenosa obrambenog signala kod miševa.